Заснований у 1948 році як Медична академія.

У 1949 році до складу Академії входило вісім клінік та два факультети. У 1949-1992 роках університет носив назву Поморського медичного університету Генерала Кароля Сверчевського. У 1992 році університет перейменований на Поморський медичний університет в Щецині.

У 2010 році реорганізований у Поморський медичний університет у Щецині.

Університет здійснює підготовку фахівців за дванадцятьма напрямками на чотирьох факультетах:

• Загальномедичний
  • Лікувальна справа (навчання польською та англійською мовами)
• Медико-стоматологічний
  • Стоматологія (навчання польською та англійською мовами)
  • Зубна гігієна
• Фармації, медичної біотехнології та лабораторної медицини
  • Біотехнології
  • Медична аналітика
  • Фармація
• Наук про здоров'я
  • Сестринська справа
  • Акушерство
  • Косметологія
  • Парамедицина
  • Охорона здоров'я
  • Фізіотерапія
  • Дієтологія.

З 1995 року в університеті працює англомовна програма для іноземців, переважно норвезьких студентів. Нині — ще й німецькомовні для студентів з Німеччини.